Микробиология и питательные среды.
Доброго времени суток! Не так давно любезный @MrBarinOFFF выложил пост о питательных средах и росте микроорганизмов на них, и я пообещала выложить пост о питательных средах.
Начну я пожалуй вообще с определений. Микробиология делится на несколько видов, например, общая, клиническая, промышленная, альгология (о сине-зеленых водорослях), санитарная. Я работаю в контроле качества на заводе, соответственно моя микробиология - санитарная - асептика и дезинфекция.
Разница с той же клинической, или, как её ещё называют, медицинской, заключается в том, что для клинической важно выделение конкретного вида бактерии, её штамма и серовара, от чего будет зависеть лечение. Для санитарной микробиологи характерно изучение микробиологической загрязненности объектов окружающей среды, пищевых продуктов, косметики и лекарств. Для таких исследований не важен вид микроорганизма (кроме группы санитарно-показательных микроорганизмов), а важно количество. Например, в таблетках допускается количество бактерий 1000 в одном грамме, в сумме с дрожжами и плесенями. Стоит отметить, что это довольно строгая норма, так как потребитель таблеток, скорее всего, больной человек и ухудшать его состояние дополнительными нагрузками в виде микрофлоры чревато для его здоровья. В тех же продуктах питания, употребляющихся в готовом виде, норма будет в пару-тройку раз выше.
При этом микробиологу контроля качества не важно, кто входит в эту тысячу микроорганизмов - сапрофитов (непатогенные микроорганизмы). Как же так, спросите вы, ведь среди них могут попасть и вредные, типа патогенной кишечной палочки, и будете правы. Именно для избежания попадания патогенной микрофлоры в продукты питания, косметику, etc выделили специальную группу микроорганизмов, обозвали её санитарно-показательные микроорганизмы.
Бактерии проходили целый кастинг на право состоять в этой группе - они должны: постоянно содержаться в выделениях человека/животного и поступать в окружающую среду в больших количествах, нигде не должны жить, кроме как у человека и животных, быть способны сохраняться длительное время в окружающей среде, сохранять свой генотип, должны быть типичными и легко определяемыми.
Идеально подойти все равно никто никогда не может, но это не беда.
Итак, вашему вниманию представляются:
Escherichia coli, известная многим как кишечная палочка, и её группа поддержки - БГКП ( бактерии группы кишечной палочки).
Pseudomonas aeruginosa, синегнойная палочка.
Staphylococcus aureus, золотистый стафилококк.
Candida albicans, кандида.
Представитель дрожжей. Вкусно пахнет хлебом при росте на агаре, вызывает молочницу. Кандидозы бывают не только у женщин, частная болячка для детей, кандидоз нёба. Лечится долго и противно, очень сильными таблетками. Из всех микроорганизмов, про которые я здесь упомянула, считается самой опасной, относится к III группе патогенности, остальные к IV.
Salmonella spp, сальмонелла.
Видов сальмонелл много, вдаваться в видовые дебри не буду. Сальмонеллез часто ассоциируется с яйцами кур, и действительно является большой проблемой, являясь самым частым возбудителем пищевых инфекций. Вызывают брюшной тиф, паратиф, сальмонеллез, цистит, пиелонефрит.
Все эти бактерии, кроме сальмонеллы, если говорить о контроле качества, ищутся в определенном количестве продукта, чаще всего - их не должно быть в 1 грамме продукта. Сальмонеллы не должно быть в 25 граммах или в 10.
Присутствие одной из этих бактерий говорит о том, что в продукте есть не только эта бактерия, но и другие патогенные, более трудно выделяемые, и такой продукт не проходит контроль качества.
Как же их обнаруживают?
Множество микробиологов изобрели, и до сих пор изобретают питательные среды для выделения конкретных видов микроорганизмов. Питательные среды делятся по одной из классификаций на сохраняющие (трансферные, в которых микроорганизмы доставляются), обогащающие (если в грамме продукта была одна колония, то эта среда даёт ей размножится, и обнаружить её невооружённым глазом), культивирования (просто на ней все растут), среды выделения определенных видов, идентификации (дифференциальные, селективные).
Среды бывают плотные, в их состав добавлен агар, по консистенции напоминают желе или мармелад, в составе могут быть добавлены разные химические соединения, ингибирующие рост одних видов, и дающие возможность расти другим.
Бывают жидкие, без агара, с теми же функциями по части селективности.
Во многие среды добавляется краситель, дабы в ходе реакции выделяемого микроорганизмом соединения, краситель среагировал с ним и изменил свой цвет. Это видно на картинке к золотистому стафилококку, изначально эта среда красная.
Самые первые среды, на которые попадает продукт это накопительные, обогащающие и среды культивирования. Наука не стоит на месте, методики меняются, я не рискну расписывать все новые методы, пройду по тем, что используется чаще всего, и с чем работаю сама. Оговорюсь заранее, номерные среды - фишка фармакопеи, названия и именные среды используются во всех других отраслях.
Питательная среда N1. Другие варианты - мясо-пептонный агар, соево-казеиновый агар, ГРМ N1 или просто среда для культивирования микроорганизмов. Самая популярная среда, на ней растут все аэробы, используется для подсчета общего количества микроорганизмов. На неё сеют продукт, воду, отбирают воздух и отсевают смывы с оборудования.
Среда N2. Также агар Сабуро. Бывает с дополнениями в виде антибиотиков, глюкозы и др. используется для культивирования плесневых грибов и дрожжей. В остальном - тоже самое, как и первая среда. Антибиотики в неё добавляют, чтобы подавить рост бактерий. Потому что по внешнему виду бактерии иногда не отличить от дрожжей.
Среда N8. Также соево-казеиновая среда. Жидкая. На ней так же растут все, есть особенности роста некоторых видов микроорганизмов, поэтому она так же используется для выделения. Например, псевдомонада растёт на ней пленкой на поверхности, с сине-зелёным отблеском, стафилококк золотистый тонкими нитями в среде, споровые бактерии растут сморщенной пленкой.
R2A агар. Новинка для меня, пришла к нам из Европы, служит для культивирования микроорганизмов при анализе воды. Не особо питательная, что помогает микробам, живущим в воде, где им нечего жрать, прийти в себя и показать себя во всей красе. Такие микроорганизмы чаще всего повреждённые и угнетённые, а эта среда для них как куриный бульончик для ослабшего от болезни. Его картинки пока нет, сама сфоткаю на днях))
Пока что все, друзья, мои пальцы померли набирать этот тест на долбанном первом айпаде, фотки все нагло сперты с Интернета, так как пока что мне не предоставился случай сфоткать на работе. Больше всего фото с кишечкой только по той причине, что её проще всего найти :) Но я исправлюсь, и если вам это было интересно, запилю продолжение о используемых средах.
И самое главное: мойте руки после туалета и улицы :)
Нежно смотрит на микроба Аспирантка С. Петрова.
Так же нежно в микроскоп- На нее глядит микроб
Пост зашел, но мне мало! :) Как подобрать антибиотики в агар Сабуро? И чем он отличается от агара Хоттингера? Можно ли выращивать бактерии в агаре Сабуро и наоборот (я полагаю, можно), и почему все-таки один лучше подходит для грибков, а другой для бактерий?И если у Вас есть ответы на мои вопросы, я буду их очень ждать!
Классно! очень познавательно) продолжайте писать в том же духе) а можете побольше о методике анализа написать при работе с конкретными средами и бактериями? какие методы чаще используете, и да, если получится, побольше фото:3
Морская миля и узел
Интересно, а знаете ли вы, что Чичерина пела песню - 40 тысяч километров?
Так вот: это не пустая цифра. Это длина экватора Земли. Земля имеет не совершенную форму, типа шара. Она «присплющена» у полюсов, и имеет название этой формы - Геоид.
А что такое миля? Я про морскую милю. Я много лет посвятил флоту.
Если окружность ( 360 градусов) это 40000 километров, значит чему равен 1 градус?
Значит мы берём 40000 километров и делим на 360.
40000/360 = 111 км. (111.(1)).
Это означает, что в 1 градусе меридиана есть 111 километров. Помните же транспортир из школы? 90 градусов (все знают, что именно при этой температуре кипит прямой угол)))
Так вот, в для различных отраслей науки это очень много. Поэтому есть более мелкие части этого «одного градуса».
В одном градусе - 60 минут. Да, есть схожесть с единицей времени. Но…. Если мы посмотрим на меридиан с точки зрения любого из полюсов Земли, то увидим циферблат! А далее работает система исчисления, принятая в часовом мире! Разве кого-то удивляет, что в одном часе 60 минут, а не 100?! И это не ИМПЕРСКАЯ система)))
Миля - 1 минута меридиана.
Посчитаем: 40000/360/60 = 1,8518…. Умеем округлять?! Так вот и выходит 1.852 того самого километра, о котором пела Чичерина.
Переводить километры в метра мы умеем умножая на 1000.
Вот так и получили милю.
Это скорость равная 1 миле в час!
Например 2 мили, которые преодолевает судно в час - 2 узла!
3 мили в час - 3 узла
37 миль в час - 37 узлов!
Моряки всегда хотели измерять скорость. Есть 2 вида скорости:
Абсолютная - это типа ты стоишь на месте а ветер с тебя кепку сдувает))
Т.е ты стоишь, а ощущение кипиша есть.
Относительная - тишь. И ты бежишь/едешь на мотике…. и ветер снова срывает кепку. (Кстати это новый термин - кажущийся ветер)
Так вот история узла:
Пройденное расстояние жестко привязано к времени. И милю мы знаем. Чтобы сократить время измерения скорости нужно кратно изменить известные величины:
1 милю мы можем разделить на 60. И это будет соответствовать 1/60 узла. Значит 1 минуте.
Так моряки и делали.
1852/60 = 30.9 метра. Вот через 30.9 метра на верёвке завязывали УЗЛЫ! Прямо вот узлы вязали.
И была проблема: что такое бросить в воду, чтобы оно типа было неподвижно?! Если доску, то она может на верёвке буксироваться следом за судном или если большое бревно - то это последнее измерение скорости для данной верёвки!
В итоге пришли к идее, типа парашюта. Бросить в воду и он «зацепится за воду». Верёвка должна быть тонкой, чтобы не искажать теорию.
Парашют называется - лаг! А верёвка - линь! (Тонкая)
Выходит 2 моряка. Один забрасывает лаг, другой засекает секундомер. И сколько узлов за 1 минуту пролетело через руку измеряющего человека - столько узлов у судна и есть!
Данным образом измерялась относительная скорость судна (относительно воды), с учётом течения она могла быть равно большей, меньшей или такой же (это истинная скорость - относительно грунта), в зависимости от направления к течению воды.
ЗЫ: меня учили, что миля - 1 минута нулевого меридиана на широте 45 градусов. Точно - наверное. Но я попытался объяснить проще, без напряга.
Гулящий гормон
Если кто забыл, напоминаю - именно так выглядит счастье на молекулярном уровне.Этот маленький «человечек» - молекула белка под названием "Миозин V" и она чепёхает по актиновой нити, таща на себе шар эндорфина, который как раз и отвечает за твое приподнятое настроение.
Пятничный спецвыпуск. Правда ли, что женский алкоголизм неизлечим?
И в чём разница между воздействием алкоголя на мужчин и женщин и для кого он опаснее?
Существует расхожее мнение о том, что женский алкоголизм нельзя полностью победить. Мы решили проверить, есть ли у этого мифа научное обоснование.
(Спойлер для ЛЛ: нет, неправда)
Несмотря на то что интересующее нас утверждение довольно популярно, МКБ-10 (Международная классификация болезней) не выделяет женский алкоголизм в отдельное заболевание. Соответственно, он не должен чем-то серьёзно отличаться от мужского. Так откуда же взялся этот миф?
Один из самых важных факторов, влияющих на успех лечения от алкоголизма, — это своевременность обращения к врачам. Чем раньше пациент начнёт лечение, тем быстрее и легче можно победить болезнь.
В среднем женщины же обращаются за медицинской помощью реже мужчин и делают это на более поздних, запущенных стадиях, поскольку стесняются своего болезненного пристрастия и, если у них есть дети, боятся проблем с органами опеки. Общество более критично относится к алкоголикам-женщинам, нежели к мужчинам. К тому же у женщин часто не бывает времени на посещение регулярных сеансов у врача или в терапевтических группах из-за работы и домашних обязанностей.
Кроме того, исследования показали, что алкоголизм у женщин чаще сопровождается психическими и психологическими проблемами, а значит, для успешного излечения им чаще требуется сопутствующая терапия. Существует мнение, что лечение алкоголизма у женщин протекает эффективнее, если оно проходит в чисто женских группах, так как, находясь с людьми своего пола, женщины чувствуют себя комфортнее и охотнее делятся личными переживаниями, которые в том числе и привели к алкогольной зависимости. Учёные сходятся во мнении, что во многих случаях лечения алкоголизма у женщин гендерно-ориентированный подход необходим. В первую очередь это касается беременных, тех, кто подвергался сексуальному насилию, а также женщин с расстройствами пищевого поведения.
При этом женщины в целом становятся алкоголиками реже мужчин. По статистике ВОЗ, мужчин, страдающих алкоголизмом, в несколько раз больше, чем женщин. Та же пропорция сохраняется и в отношении тех, для кого алкоголизм стал смертельным: в 2018 году от чрезмерного употребления алкоголя умерло около 3 млн человек по всему миру, и три четверти из них — мужчины. Логично предположить, что, если бы алкоголизм у женщин, в отличие от мужчин, не вылечивался, распределение было бы несколько иным.
Некоторое время назад даже в научных кругах существовало мнение, что женщины, хоть и начинают пить в более позднем возрасте, быстрее мужчин приобретают зависимость. Это называли телескопическим эффектом. Однако такие выводы были основаны на сравнительно небольшой выборке.
Позже в США были проведены два исследования с разницей в десять лет. Были проанализированы возраст начала употребления алкоголя, время от первого употребления до зависимости и время от формирования зависимости до начала лечения. В исследовании принимали участие пациенты пяти разных возрастных групп. В итоге учёные обобщили результаты этих двух исследований и не нашли достаточных доказательств существования телескопического эффекта у женщин.
Однако алкоголь действительно влияет на женский и мужской организмы по-разному. Так, например, женщины пьянеют быстрее мужчин, и это связано не только с разницей в весе. Дело в том, что в женском теле содержится меньше воды и больше жира, чем в мужском. В воде алкоголь растворяется и, соответственно, быстрее теряет концентрацию. В жировой ткани же он, напротив, накапливается. К тому же у женщин вырабатывается меньше алкогольдегидрогеназы — фермента, который расщепляет алкоголь. Поэтому одна доза спиртного для мужчины эквивалентна двум дозам для женщин (при одинаковом росте и весе).
Помимо этого, некоторые исследователи утверждают, что восприимчивость женского организма к алкоголю меняется в зависимости от фазы менструального цикла. После овуляции и до начала менструации из-за колебания уровня гормонов эстрогена и прогестерона в женском организме алкоголь перерабатывается медленнее, а значит, его концентрация в крови выше при том же количестве выпитого. Впрочем, по этому поводу учёные к консенсусу пока не пришли.
Таким образом, алкоголь действительно оказывает на женский организм более сильное негативное воздействие, чем на мужской. К тому же часто женщинам нужно специализированное гендерно-ориентированное лечение и сопутствующая психотерапия. Однако нет никаких доказательств или более-менее серьёзных аргументов в пользу того, что женский алкоголизм неизлечим.
Наш вердикт: неправда
Ещё нас можно читать в Телеграме, в Фейсбуке и в Вконтакте
В сообществах отсутствуют спам, реклама и пропаганда чего-либо (за исключением здравого смысла).
Почитать по теме:
Насекомые под микроскопом
Личинка трупной мухи
Нижняя часть головы цикады-пенницы
Голова муравья - солдата
Правда ли, что дисбактериоза как диагноза не существует?
. и что пробиотики бесполезны?
И врачи, и пациенты списывают многочисленные проблемы с желудочно-кишечным трактом на дисбактериоз. Основным способом лечения в таком случае считается назначение пробиотиков, которые призваны заселить кишечник полезными бактериями и избавить пациента от неприятных симптомов. Особенно часто курс пробиотиков назначают параллельно с лечением антибиотиками. Мы проверили, есть ли научное обоснование таких действий.
(Спойлер для ЛЛ:
- дисбактериоз нельзя считать полноценным диагнозом и списывать все симптомы на него;
- в большинстве случаев при приёме антибиотиков назначение пробиотиков бессмысленно, а порой и небезопасно;
- "полезные" бактерии чаще всего уже десять раз мертвы на момент попадания в кишечник;
- бессмысленно и переплачивать за «живые» йогурты и БАДы в надежде избавиться разом от целого ряда проблем со здоровьем;
- абсолютное большинство продуктов, обещающих заселить кишечник полезными бактериями, — просто маркетинговая уловка для повышения продаж.
Аргументация — простыня ниже :)
На постсоветском пространстве под дисбактериозом в медицине обычно понимают некое изменение состава бактерий в толстом кишечнике. Однако в зарубежной практике, в частности в Международной классификации болезней (МКБ-10), такого диагноза нет. Кандидат медицинских наук Владимир Василенко подсчитал, что, «осуществляя поиск в мировой научной базе данных по медицине "Медлайн" по ключевому слову dysbacteriosis ("дисбактериоз"), мы узнаем, что оно присутствует в заголовках 257 научных работ, опубликованных с 1966 по 2000 год, 250 из них — в русскоязычных медицинских журналах, ещё четыре принадлежат авторам из прежнего социалистического лагеря».
Хотя в России и существует ряд лабораторных анализов (например, посев кала на дисбактериоз и анализ микробных маркеров методом газовой хромато-масс-спектрометрии по Осипову), призванных подтвердить или опровергнуть диагноз у пациента, практикующие специалисты доказательной медицины подвергают их методологию и результаты сомнению. Алексей Головенко, кандидат медицинских наук, гастроэнтеролог, объясняет:
О бессмысленности таких анализов также высказывается Татьяна Тихомирова в колонке научпоп-издания «Популярная механика»:
Отсутствие признания болезни в других странах, вопросы к методологии анализов и к интерпретации их результатов, а также недостаточная изученность микроорганизмов толстой кишки приводит нас к выводу, что понятие «дисбактериоз» никак не может быть диагнозом. Максимум этим словом можно характеризовать какие-то нарушения без указания причины их возникновения. В этом как раз и кроется опасность выставления такого диагноза врачом по жалобам пациента.
Специалисты доказательной медицины отмечают, что таким образом могут быть пропущены и не выявлены куда более серьёзные диагнозы: синдром раздражённого кишечника, болезнь Крона, лактазная недостаточность и даже рак.
Самые часто назначаемые группы препаратов при выставленном диагнозе дисбактериоз:
🔸 пробиотики (содержат полезные бактерии в высушенном или растворённом виде);
🔸 пребиотики (не перевариваются и не усваиваются в верхних отделах желудочно-кишечного тракта, но ферментируются микрофлорой толстого кишечника и стимулируют её рост и жизнедеятельность);
🔸 эубиотики (живые микроорганизмы и продукты их жизнедеятельности, оказывающие нормализующее воздействие на состав и биологическую активность микрофлоры пищеварительного тракта).
Эти же названия используются в рекламе всевозможных биологически активных добавок (БАДов), а также «живых» йогуртов и других продуктов питания «для кишечника».
Разделение бактерий на полезные и вредные весьма условно. Во-первых, качественный и количественный состав бактерий в толстом кишечнике варьируется в зависимости от места проживания человека. Попаданием в непривычную среду как раз и объясняются проблемы с ЖКТ, возникающие во время путешествия. Во-вторых, как уже говорилось выше, состав микрофлоры кишечника изучен недостаточно. Наконец, в-третьих, в 1 г содержимого толстой кишки живёт порядка 10^11 — 10^12 бактерий (Для протокола: это степень числа, Пикабу не дает ставить надстрочные символы). Содержание же бактерий в БАДах, таблетках или йогуртах в разы меньше. Более того, большая часть, например, лактобактерий, поступающих с пищей, уничтожается соляной кислотой в желудке в течение четырех часов. Стоит отметить, что при этом рынок пробиотиков огромен: в 2017 году он составил более $1,8 млрд, а к 2024 году, по прогнозам экономистов, достигнет $66 млрд. При этом препараты не имеют доказанной эффективности, а в некоторых случаях приносят больше вреда, чем пользы.
Группа израильских учёных изучила необходимость использования пробиотиков в рамках антибактериальной терапии. Разделив пациентов, принимающих антибиотики, на три группы, учёные назначили одной группе пробиотики, второй — аутотрансплантацию (пересадку самому себе) фекалий, взятых у них же до начала лечения, а третья группа не принимала ничего, кроме самой антибактериальной терапии. Самое быстрое восстановление микрофлоры кишечника продемонстрировала вторая группа. При этом группа, принимавшая пробиотики, восстанавливалась хуже, чем группа, не принимавшая ничего.
Не оказали пробиотики целебного действия и на детей с гастроэнтеритом. В исследовании приняли участие 886 детей с гастроэнтеритом в возрасте от трёх месяцев до четырёх лет. Часть из них получали пробиотики, а часть — плацебо. Выяснилось, что в группе пробиотиков умеренное или тяжёлое течение болезни на двухнедельном отрезке было у 26,1% испытуемых, а в группе плацебо — у 24,7%. При этом с точки зрения симптомов (диареи и рвоты) никакой разницы не было вообще. Есть отдельные случаи, когда приём пробиотиков способствовал фунгемии — распространению грибковой инфекции в крови пациента.
В систематическом обзоре рандомизированных контролируемых исследований пробиотиков 2016 года учёные не выявили никакого воздействия пробиотиков на кишечную микрофлору здоровых взрослых людей. Есть отдельные краткосрочные исследования, показывающие эффективность отдельных групп бактерий. Например, приём Lactobacillus casei Shirota показал среди пациентов с хроническими запорами улучшение на 89% против улучшения на 56% в группе плацебо. Однако, как отмечают исследователи, пробиотик — не полноценное лечение, а лишь дополнение к нему.
С пребиотиками — по сути, пищей для бактерий — ситуация более однозначная. Нет никаких данных об их доказанной пользе при лечении или профилактике каких-либо заболеваний. Инфекционист Дмитрий Трощанский объясняет:
Не вылечат от десятка заболеваний и эубиотики — якобы живые организмы внутри БАДов или йогуртов. Во-первых, до 90% живых бактерий в них не доживают до попадания на наш стол. Во-вторых, большая часть «выживших» будет растворена соляной кислотой, входящей в состав желудочного сока. А те единицы, которые всё-таки попадут в толстый кишечник, будут настолько ослаблены, что не смогут противостоять его «коренным» обитателям.
При этом полностью относить пробиотики к «фуфломицинам» не стоит. Эран Элинав из Института Вайцмана (Израиль) предсказывает, что с повышением доступности создания генетического профиля пациента они могут стать персонализированными лекарствами, то есть изготовленными специально под каждого пациента и эффективными только для него. Похожим образом описывают будущее пробиотиков и пребиотиков в журнале «Тренды микробиологии», но, к сожалению, на сегодняшний день таких индивидуальных разработок фармакологическая индустрия не имеет.
Таким образом, дисбактериоз нельзя считать полноценным диагнозом и списывать все симптомы на него. В большинстве случаев при приёме антибиотиков назначение пробиотиков бессмысленно, а порой и небезопасно. Также бессмысленно и переплачивать за «живые» йогурты и БАДы в надежде избавиться разом от целого ряда проблем со здоровьем. Абсолютное большинство продуктов, обещающих заселить кишечник полезными бактериями, — просто маркетинговая уловка для повышения продаж.
Ещё нас можно читать в Телеграме, в Фейсбуке и в Вконтакте
В сообществах отсутствуют спам, реклама и пропаганда чего-либо (за исключением здравого смысла).